Chondroitinsulfat ist in allem zu finden, von Nematoden bis zum Menschen, mit Ausnahme von Pflanzen, und spielt viele wichtige physiologische Funktionen. Obwohl die Hauptkettenstruktur des Polysaccharids nicht komplex ist, ist sie in Bezug auf den Sulfatierungsgrad, die Sulfatgruppe und die Verteilung der beiden verschiedenen Arten von Isomeruronsäure-Wiederherstellungen stark heterogen.